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我國科學家首次完成仿刺參基因組測序和組裝
本報青島訊 中國科學院海洋研究所日前在青島宣布,我國科學家國際上首次完成仿刺參基因組測序和組裝,開啟了刺參生物學和遺傳育種研究的新時代。
該成果由中國科學院海洋研究所楊紅生研究員團隊和相建海研究員團隊共同完成,在天津生物芯片技術公司的技術支撐下,突破了刺參復雜基因組測序和組裝技術瓶頸,采用新一代測序技術獲得132Gb高質量DNA序列數據,覆蓋全基因組160倍。科研人員利用針對高復雜度基因組組裝的創新策略,在國際上首次成功完成了野生刺參的基因組組裝,目前獲得的框架圖總長度達到765Mb,組裝疊連群Contig N50達112Kb,該數值優于國際迄今已發表的多數水產動物基因組圖譜的指標。初步檢測表明,功能基因區覆蓋達95%以上。
“經過基因組探查,仿刺參基因組屬高雜合度復雜基因組。”相建海研究員介紹,仿刺參基因組的測序和組裝,將為刺參的繁殖發育、免疫調控、營養代謝、遺傳解析提供重要理論支撐。下一步將整合科研團隊力量,進行刺參重要經濟性狀解析、分子標記輔助選育和全基因組遺傳育種研究,開展揭示刺參的夏眠、再生、自溶等特殊生命現象的機理機制等相關研究,為我國刺參產業健康可持續發展提供有力科技支撐。
作者： 薄克國 通訊員 劉洋 報道 來源： 大眾日報
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